Pengamanan turut diperkuat dengan penempatan personel di sejumlah gereja besar di wilayah Jepara.
Pengamanan gereja dilaksanakan sesuai standar operasional prosedur, mulai dari sterilisasi hingga pengamanan selama rangkaian ibadah berlangsung.
Polres Jepara juga melibatkan TNI, Satpol PP, Dinas Perhubungan, serta unsur organisasi keagamaan dan kemasyarakatan dalam mendukung kelancaran pengamanan Nataru.